Der Hafen von Rethymno ist ein wichtiger Teil der Gemeinde, mit einer Landfläche von 31.000 Quadratmetern und Plattformen von 900 Metern Länge. Er befindet sich in einer erstklassigen Lage an den nördlichen und westlichen Küsten von Rethymno und ist somit leicht zugänglich für Schiffe, die den Hafen ansteuern. Der Hafen wurde als national wichtig eingestuft, da er durchschnittlich 230 Schiffsankünfte pro Jahr verzeichnet.
Dieser gemischt genutzte Hafen dient sowohl dem kommerziellen als auch dem Passagierverkehr, wobei alle Arten von Fracht im westlichen Teil des Hafens abgefertigt werden. Darüber hinaus werden hier gelegentlich Touristenboote angelegt und es gibt eine Waage mit einer Kapazität von 80 Tonnen. Der Hafen verfügt über fünf Frachtplattformen, die mit A, B, C, D und E gekennzeichnet sind und je nach Größe bis zu fünf Schiffe gleichzeitig aufnehmen können.
Während der Hauptzweck der Plattformen darin besteht, den kommerziellen Verkehr des Hafens zu bedienen, können sie auch genutzt werden, um Touristenboote mit einer Länge von mehr als 150 Metern zu versorgen. Die Plattform in Position D ist aufgrund ihrer Länge und Tiefe am besten für diese größeren Boote geeignet.
Die kommerzielle Station des Hafens hat eine Gesamtlänge von 810 Metern und eine nutzbare Tiefe von -6,00 bis -8,00 Metern. Die Landzone erstreckt sich über 26.500 Quadratmeter und bietet ausreichend Platz für Frachtoperationen und andere Aktivitäten.
In Bezug auf die Sicherheit folgt der Hafen von Rethymno den Richtlinien des Internationalen Codes für die Sicherung von Schiffen und Hafenanlagen (ISPS-Code). Dadurch wird sichergestellt, dass alle notwendigen Sicherheitsmaßnahmen und -verfahren zum Schutz der Hafenanlagen, Schiffe, Mitarbeiter und Fracht vorhanden sind. Diese Maßnahmen entsprechen dem Code der Internationalen Seeschifffahrts-Organisation (IMO) und zielen darauf ab, die allgemeine Sicherheit im internationalen Seeverkehr zu verbessern.
Der Hafen von Rethymno liegt in der Region Rethymno und ist vom Flughafen Chania aus leicht erreichbar, der 68 Kilometer entfernt ist und etwa 1 Stunde und 6 Minuten mit dem Auto benötigt. Er ist auch nur 82 Kilometer vom Flughafen Heraklion entfernt, mit einer Fahrzeit von 1 Stunde und 13 Minuten. Mit seiner strategischen Lage und effizienten Betrieb ist der Hafen von Rethymno ein wichtiger Knotenpunkt für kommerzielle und touristische Aktivitäten in der Region.